Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms