Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms