Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms