Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CUL4BQ13620 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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