Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms