Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP35Q9P2H5 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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