Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC104435.2-201ENST00000478745 866 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KIAA0040-203ENST00000545251 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 THRAP3P1-201ENST00000411753 2786 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PRR5L-216ENST00000530639 2291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LINC01166-201ENST00000443633 2619 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RIC3-203ENST00000343202 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC122129.1-201ENST00000354746 1815 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MIR124-2HG-203ENST00000521441 2840 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC073578.3-201ENST00000624926 4191 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SERPINA3-204ENST00000482740 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ATP6V1H-207ENST00000520188 1967 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZSCAN2-204ENST00000358472 3231 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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LSAMPQ13449 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PSMD10-201ENST00000217958 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GAPDHP72-202ENST00000636791 2141 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 NRIP2-201ENST00000337508 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 BCAS1-201ENST00000371435 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 TSPYL1-201ENST00000368608 3326 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC010201.2-201ENST00000605595 1495 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 VIPAS39-211ENST00000557658 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 MMP2-203ENST00000543485 1978 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 PCID2-204ENST00000375459 1668 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LSAMPQ13449 GOLGA8DP-201ENST00000314246 2786 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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