Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC090192.2-201ENST00000517482 553 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RN7SL238P-201ENST00000613832 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 Metazoa_SRP.139-201ENST00000616096 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RN7SL106P-201ENST00000618104 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL049871.1-201ENST00000557475 880 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.2 ms