Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms