Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQV3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQV3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQV3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQV3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQV3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQV3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQV3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQV3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQV3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQV3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQV3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQV3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KQV3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U3KQV3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KQV3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KQV3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KQV3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
U3KQV3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQV3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQV3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQV3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQV3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQV3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQV3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQV3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQV3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQV3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQV3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQV3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQV3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
U3KQV3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms