Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A4Q9Y6R1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms