Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BACE2Q9Y5Z0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BACE2Q9Y5Z0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms