Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms