Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms