Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms