Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIK3Q9Y2K2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK3Q9Y2K2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms