Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GINS2Q9Y248 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINS2Q9Y248 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms