Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF3IP3Q9Y228 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF3IP3Q9Y228 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms