Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms