Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC5Q9UQL6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC5Q9UQL6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms