Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS3Q9UPU3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS3Q9UPU3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms