Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TPCN1Q9ULQ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPCN1Q9ULQ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms