Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
INO80Q9ULG1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
INO80Q9ULG1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms