Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMFRQ9UKV5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms