Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
RCAN3Q9UKA8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCAN3Q9UKA8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCAN3Q9UKA8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms