Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK32

RPS6KA6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA6Q9UK32 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KA6Q9UK32 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KA6Q9UK32 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KA6Q9UK32 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KA6Q9UK32 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KA6Q9UK32 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KA6Q9UK32 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KA6Q9UK32 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KA6Q9UK32 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS6KA6Q9UK32 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KA6Q9UK32 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms