Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA2Q9UJY4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GGA2Q9UJY4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms