Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNA1Q9UIW2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNA1Q9UIW2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms