Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPN4Q9UHM6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms