Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT1Q9UHJ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT1Q9UHJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms