Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MLH3Q9UHC1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MLH3Q9UHC1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms