Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms