Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA6Q9UF33 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA6Q9UF33 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms