Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms