Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VAPAQ9P0L0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAPAQ9P0L0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms