Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 359.8 ms