Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GGA3Q9NZ52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
GGA3Q9NZ52 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA3Q9NZ52 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms