Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms