Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
C1orf109Q9NX04 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms