Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLN6Q9NWW5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN6Q9NWW5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms