Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3BQ9NW08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms