Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A2Q9NTI2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 958.5 ms