Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms