Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL1Q9NSC2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms