Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOMER2Q9NSB8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOMER2Q9NSB8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms