Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
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