Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRC1-209ENST00000480561 1014 ntTSL 215.97■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-210ENST00000491560 658 ntTSL 25.42□□□□□ -1.541e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-207ENST00000481899 738 ntTSL 25.28□□□□□ -1.561e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.434e-14■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL21-202ENST00000311549 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.544e-14■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL21-201ENST00000272274 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.634e-14■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL21-204ENST00000326092 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.684e-14■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL21-208ENST00000483765 453 ntTSL 33.58□□□□□ -1.844e-14■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL21-205ENST00000461690 681 ntTSL 53.06□□□□□ -1.924e-14■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPL21-209ENST00000485756 675 ntTSL 22.56□□□□□ -24e-14■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPS26-203ENST00000552361 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPS26-202ENST00000548590 1204 ntTSL 510.59□□□□□ -0.712e-6■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV2-205ENST00000474740 264 ntTSL 23.05□□□□□ -1.921e-9■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-9■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 PDAP1-204ENST00000496335 302 ntTSL 315.79■□□□□ 0.123e-9■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 UBL5-203ENST00000588141 573 ntTSL 422.77■■□□□ 1.247e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.017e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.97e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 UBL5-206ENST00000589960 307 ntTSL 319.97■□□□□ 0.797e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 UBL5-205ENST00000589372 1450 ntTSL 219.71■□□□□ 0.757e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.237e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.537e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5I-205ENST00000515202 393 ntTSL 28.28□□□□□ -1.085e-12■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-8■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.223e-8■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.243e-8■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 211.55□□□□□ -0.566e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.716e-7■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 GSTP1-206ENST00000495996 221 ntTSL 210.28□□□□□ -0.763e-17■□□□□ 10.2
APOBEC3CQ9NRW3 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.073e-9■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.514e-14■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-213ENST00000580320 915 ntTSL 223.75■■□□□ 1.391e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-206ENST00000578273 877 ntTSL 523.41■■□□□ 1.341e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-210ENST00000579334 1251 ntTSL 523.17■■□□□ 1.31e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-207ENST00000578885 968 ntTSL 523.15■■□□□ 1.31e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.271e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-214ENST00000580750 1076 ntTSL 522.6■■□□□ 1.211e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-212ENST00000579842 715 ntTSL 322.08■■□□□ 1.131e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-218ENST00000582900 676 ntTSL 322.08■■□□□ 1.131e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 COPE-208ENST00000598969 1770 ntTSL 522.04■■□□□ 1.125e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-215ENST00000581584 766 ntTSL 321.47■■□□□ 1.031e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 GRN-205ENST00000586443 1557 ntTSL 319.5■□□□□ 0.711e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.291e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 GRN-204ENST00000586242 665 ntTSL 316.54■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.081e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.071e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-211ENST00000579821 452 ntTSL 313.99□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 10.1
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APOBEC3CQ9NRW3 COPE-205ENST00000595984 434 ntTSL 313.23□□□□□ -0.295e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-216ENST00000582074 631 ntTSL 312.2□□□□□ -0.461e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-202ENST00000577286 553 ntTSL 212.06□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DCXR-203ENST00000577532 573 ntTSL 39.03□□□□□ -0.961e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.221e-7■□□□□ 10.1
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APOBEC3CQ9NRW3 UROD-207ENST00000462688 901 ntTSL 513.65□□□□□ -0.224e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-220ENST00000496439 800 ntTSL 212.19□□□□□ -0.464e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-217ENST00000491300 884 ntTSL 512.09□□□□□ -0.474e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-203ENST00000434478 600 ntTSL 312.06□□□□□ -0.484e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-216ENST00000490385 860 ntTSL 510.91□□□□□ -0.664e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-204ENST00000460334 663 ntTSL 510.37□□□□□ -0.754e-7■□□□□ 10.1
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APOBEC3CQ9NRW3 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-36■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPL11-205ENST00000482370 879 ntTSL 1 (best)9.69□□□□□ -0.862e-36■□□□□ 10.1
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APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 514.75□□□□□ -0.056e-8■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 213.66□□□□□ -0.226e-8■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.376e-8■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.726e-8■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.166e-8■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR5-202ENST00000464240 1830 ntTSL 220.05■□□□□ 0.86e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.636e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.636e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.636e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.616e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.396e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.36e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.36e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.36e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.216e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DIAPH1-205ENST00000448451 2102 ntTSL 213□□□□□ -0.336e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.776e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.426e-7■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.216e-13■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 ENO1-206ENST00000497492 647 ntTSL 213.45□□□□□ -0.265e-15■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.415e-15■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.636e-13■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 ENO1-205ENST00000492343 826 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.985e-15■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 ENO1-203ENST00000486051 536 ntTSL 36.97□□□□□ -1.295e-15■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-212ENST00000547993 2481 ntTSL 1 (best)5.94□□□□□ -1.466e-13■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-208ENST00000547529 892 ntTSL 53.87□□□□□ -1.796e-13■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-211ENST00000547969 543 ntTSL 42.92□□□□□ -1.946e-13■□□□□ 10.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.616e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPS29-207ENST00000557367 499 ntTSL 214.78□□□□□ -0.046e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.226e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.286e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6AP1-209ENST00000491569 2079 ntTSL 221.29■■□□□ 19e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.939e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP1-207ENST00000567969 581 ntTSL 220.64■□□□□ 0.899e-9■□□□□ 10
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