Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYO5CQ9NQX4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYO5CQ9NQX4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYO5CQ9NQX4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYO5CQ9NQX4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYO5CQ9NQX4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
MYO5CQ9NQX4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MYO5CQ9NQX4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYO5CQ9NQX4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
MYO5CQ9NQX4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYO5CQ9NQX4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYO5CQ9NQX4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
MYO5CQ9NQX4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYO5CQ9NQX4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYO5CQ9NQX4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MYO5CQ9NQX4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms