Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC177Q9NQR7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC177Q9NQR7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms