Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYLDQ9NQC7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYLDQ9NQC7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLDQ9NQC7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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